La espiritualidad del instituto "Stabat Mater" la definía el P. Tomás Morales como "tronco ignaciano y savia carmelitana". Se trata de un estilo de vida espiritual basado en la aportación de los Ejercicios Espirituales y toda la tradición jesuítica, enriquecido por el estilo Carmelitano que, en ambiente familiar y sencillo vive la aportación de santa Teresa de Jesús, san Juan de la Cruz y santa Teresita del niño Jesús. El amor entrañable al Señor y la confianza hasta la audacia en su misericordia forman parte de nuestra espiritualidad. Abelardo de Armas, hijo fiel del P. Morales vivió de forma muy intensa esta espiritualidad de la Misericordia de Dios.